A equipe de educação ambiental é formada por biólogos e outros profissionais da área ambiental e educacional, que trabalham diariamente para sensibilizar o público em relação às questões ambientais da atualidade. Para isso são utilizadas técnicas didáticas para melhor transmitir informações sobre os animais e o meio onde eles vivem, para o entendimento de todos os públicos e grupos previamente agendados sendo escolares ou não. Além dessas atividades, a equipe desenvolve ações ambientais correlacionadas a um calendário ambiental anual, para aumentar o engajamento do público e alcançarmos em equipe o propósito da Educação Ambiental do Aquário de São Paulo.